Z6·尊龙凯时的单细胞测序技术,特别是基于10×genomics的应用,利用了一种革新性的方法来解析细胞的基因组、转录组和表观组数据。这一技术遵循以下核心步骤:
单细胞悬浮液制备
首先,将组织或细胞样本转化为单细胞悬浮液,通常通过机械或酶的处理来实现。
微滴封装
接下来,单细胞悬浮液与特定的含有独特分子标签(条形码)的凝胶珠混合。利用微流体技术,将每个细胞与一颗凝胶珠一同封装到微滴中,最佳情况下每个微滴应只包含一个细胞和一个凝胶珠。
mRNA捕获与条形码标记
在微滴内,细胞破裂后释放出mRNA。这些mRNA与带有聚A尾的寡核苷酸探针结合,捕获带有细胞特异性条形码和独特分子标识符(UMI)的mRNA,UMI有助于消除PCR扩增过程中的偏差,以便更精确地估算原始mRNA分子的数量。
逆转录与扩增
捕获到的mRNA被逆转录成cDNA,并在微滴中进行PCR扩增。在此过程当中,细胞特异性条形码和UMI被保留并扩增至每个cDNA分子中。
cDNA文库制备
接着,扩增得到的cDNA从微滴中收集,形成一个测序文库,文库中的cDNA分子均带有细胞特异性条形码和UMI。
高通量测序
最后,使用高通量测序平台(如Illumina)对cDNA文库进行测序,获得的数据将用于后续分析,例如基因表达水平、细胞异质性及细胞亚群的鉴定等。
数据分析
对测序数据进行处理与分析,分配读取(reads)至不同细胞并依据UMI计算基因表达量。此外,借助这些数据还能深入进行生物信息学的各种分析,如细胞聚类、识别差异表达基因及细胞间相互作用的研究。
可重复性与指导意义
在单细胞测序与转录组测序的研究中,关注其可重复性与指导意义显得尤为重要。以下几个方面需重点考虑:
1. 可重复性
单细胞测序和转录组测序的结果需要通过严格的实验设计和操作来保证其可重复性。来自样品制备到数据处理的各个环节,都可能影响实验的可靠性。因此,研究者需关注这些流程,实施严格的质量控制。
2. 生物学背景
研究者需要深入理解所研究的生物系统及其背景,以更充分地利用单细胞测序和转录组测序所提供的信息。这涉及到基因表达和调控的知识,必要的领域专业知识能够帮助研究者解释数据并得出合理结论。
3. 数据解析与解释
数据分析是单细胞测序和转录组测序的关键环节。选择适当的分析方法并正确解读结果对于实验的指导意义至关重要。研究者需采用经过验证的分析工具和流程,并根据特定研究问题调整参数。
4. 整合其他数据类型
单细胞测序和转录组测序所提供的信息虽有价值,通常还需与基因组、表观组及蛋白组等其他数据类型相结合,才能更全面地理解生物过程。通过整合不同数据,可以更深刻地了解基因调控和功能,进而提升研究的指导意义。
Z6·尊龙凯时专注于提供高质量的生物质谱和单细胞分析服务,致力于为生物/制药行业带来重大的科研支持。我们的服务将满足您在药物研发、生产及质量监控等方面的各类需求。